Všetkých 51 nominácií hodnotila nezávislá komisia, ktorú zostavila Nadácia Pontis v spolupráci s Poradným výborom. Garantom transparentnosti hodnotiaceho procesu bola audítorská spoločnosť KPMG Slovensko, spol. s r.o. Členmi hodnotiacej komisie Via Bona Slovakia 2004 boli:

• Simona Bubánová, CD Ogilvy & Mather
• Branislav Cehlárik, Citigroup
• Táňa Hlavatá, Nadace VIA, Česká republika
• Vladimír Michal, Artfórum
• Zuzana Mistríková, Ministerstvo kultúry SR
• Martin Podstupka, Hospodárske noviny
• Balázs Sátor, The Civil Society Development Foundation, Maďarsko
• Katarína Šulíková, U. S. Steel Košice, s.r.o.