Hodnotiaca komisia je zložená z renomovaných odborníkov a expertov v jednotlivých oblastiach, ktoré sú predmetom ocenenia.  Členstvo v komisii je čestné a nezastupiteľné. Zloženie honotiacej komisie navrhuje a zostavuje Nadácia Pontis. 

Členovia hodnotiacej komisie ocenenia Via Bona Slovakia za rok 2009 v abecednom poradí:

Ján Bača (U.S. Steel Košice)
Simona Bubánová (Creative Department)
Marianna Butkovská (týždenník Trend)
Jana Debrecéniová (Občan a demokracia)
Gabriela Dubcová (Ekonomická univerzita)
Iveta Griačová (Innovative Management Partner)
Marcela Havrilová (Junior Achievement)
Pavel Hrica (Nadácia Pontis)
Marián Huba (Slovenský zväz ochrancov prírody a krajiny)
Pavol Jablonický (Fond sociálneho rozvoja)
Stanislav Janota (SITA)
Miloslava Jezná (Ministerstvo práce, sociálnych vecí a rodiny SR)
Viliam Krížik (Slovenská agentúra pre životné prostredie)
Ján Marušinec (MESA 10)
Martin Mazag (mesačník Stratégie)
Anna Remišová (Bratislavská vysoká škola práva)
Ján Orlovský (Západoslovenská energetika)
Ján Pallo (The Slovak Spectator)
Lucie Schweizer (DLA Piper)
Lenka Surotchak (Nadácia Pontis)
Ondrej Šebesta (Slovenský plynárenský priemysel)
Martina Vagačová (ETP International)